工伤职工自己垫付医药费的，可以向社保经办机构申请报销，或者由单位经办人携带规定资料前往社保机构办理报销手续，或者在出院时候直接进行结算。如果单位没有缴纳工伤保险费，则该笔费用可以从工伤保险基金中先行支付，然后由用人单位偿还。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国社会保险法》第四十一条
职工所在用人单位未依法缴纳工伤保险费，发生工伤事故的，由用人单位支付工伤保险待遇。用人单位不支付的，从工伤保险基金中先行支付。
从工伤保险基金中先行支付的工伤保险待遇应当由用人单位偿还。用人单位不偿还的，社会保险经办机构可以依照本法第六十三条的规定追偿。